Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms