Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC160A6NGH7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC160A6NGH7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC160A6NGH7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC160A6NGH7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC160A6NGH7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC160A6NGH7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms