Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms