Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms