Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEFA5A3E0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms