Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LCHNA4D1U4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms