Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PIPSLA2A3N6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIPSLA2A3N6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms