Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R4GN57 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R4GN57 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R4GN57 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R4GN57 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R4GN57 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R4GN57 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R4GN57 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R4GN57 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R4GN57 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
R4GN57 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R4GN57 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R4GN57 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R4GN57 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R4GN57 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R4GN57 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R4GN57 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R4GN57 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R4GN57 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R4GN57 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R4GN57 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R4GN57 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R4GN57 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R4GN57 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R4GN57 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
R4GN57 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R4GN57 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R4GN57 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R4GN57 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R4GN57 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R4GN57 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R4GN57 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
R4GN57 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R4GN57 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R4GN57 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
R4GN57 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R4GN57 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R4GN57 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R4GN57 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R4GN57 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R4GN57 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R4GN57 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R4GN57 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R4GN57 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R4GN57 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
R4GN57 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R4GN57 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R4GN57 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
R4GN57 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
R4GN57 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
R4GN57 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R4GN57 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
R4GN57 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
R4GN57 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R4GN57 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
R4GN57 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R4GN57 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
R4GN57 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R4GN57 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R4GN57 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R4GN57 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
R4GN57 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R4GN57 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R4GN57 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
R4GN57 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
R4GN57 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R4GN57 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R4GN57 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
R4GN57 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
R4GN57 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R4GN57 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R4GN57 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
R4GN57 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
R4GN57 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R4GN57 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R4GN57 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
R4GN57 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R4GN57 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R4GN57 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R4GN57 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R4GN57 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms