Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX8Q9Y5X2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX8Q9Y5X2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX8Q9Y5X2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms