Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH3BP1Q9Y3L3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3BP1Q9Y3L3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3BP1Q9Y3L3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH3BP1Q9Y3L3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms