Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC1Q9Y3B2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC1Q9Y3B2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXOSC1Q9Y3B2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC1Q9Y3B2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC1Q9Y3B2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC1Q9Y3B2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC1Q9Y3B2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC1Q9Y3B2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC1Q9Y3B2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC1Q9Y3B2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC1Q9Y3B2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms