Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D4Q9Y2X8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D4Q9Y2X8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D4Q9Y2X8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2D4Q9Y2X8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2D4Q9Y2X8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D4Q9Y2X8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D4Q9Y2X8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D4Q9Y2X8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2D4Q9Y2X8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms