Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GIT1Q9Y2X7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GIT1Q9Y2X7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GIT1Q9Y2X7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GIT1Q9Y2X7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GIT1Q9Y2X7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GIT1Q9Y2X7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GIT1Q9Y2X7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GIT1Q9Y2X7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GIT1Q9Y2X7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GIT1Q9Y2X7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GIT1Q9Y2X7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GIT1Q9Y2X7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms