Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M1Q9Y2T2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M1Q9Y2T2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M1Q9Y2T2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3M1Q9Y2T2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M1Q9Y2T2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M1Q9Y2T2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3M1Q9Y2T2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3M1Q9Y2T2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms