Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCKAP1Q9Y2A7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCKAP1Q9Y2A7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCKAP1Q9Y2A7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCKAP1Q9Y2A7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKAP1Q9Y2A7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1Q9Y2A7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1Q9Y2A7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms