Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP3Q9UQV4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMP3Q9UQV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP3Q9UQV4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP3Q9UQV4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP3Q9UQV4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP3Q9UQV4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms