Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX12Q9UMY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX12Q9UMY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX12Q9UMY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX12Q9UMY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX12Q9UMY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX12Q9UMY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX12Q9UMY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms