Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NENFQ9UMX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NENFQ9UMX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NENFQ9UMX5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NENFQ9UMX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NENFQ9UMX5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NENFQ9UMX5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NENFQ9UMX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NENFQ9UMX5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NENFQ9UMX5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NENFQ9UMX5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms