Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGAT4AQ9UM21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGAT4AQ9UM21 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT4AQ9UM21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4AQ9UM21 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGAT4AQ9UM21 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.5 ms