Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NWD2Q9ULI1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NWD2Q9ULI1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NWD2Q9ULI1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NWD2Q9ULI1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NWD2Q9ULI1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NWD2Q9ULI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NWD2Q9ULI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NWD2Q9ULI1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NWD2Q9ULI1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NWD2Q9ULI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NWD2Q9ULI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NWD2Q9ULI1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NWD2Q9ULI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NWD2Q9ULI1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NWD2Q9ULI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NWD2Q9ULI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NWD2Q9ULI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NWD2Q9ULI1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NWD2Q9ULI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NWD2Q9ULI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NWD2Q9ULI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms