Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNH3Q9ULD8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KCNH3Q9ULD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNH3Q9ULD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNH3Q9ULD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KCNH3Q9ULD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KCNH3Q9ULD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCNH3Q9ULD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
KCNH3Q9ULD8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNH3Q9ULD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNH3Q9ULD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNH3Q9ULD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms