Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NRXN1Q9ULB1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NRXN1Q9ULB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NRXN1Q9ULB1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NRXN1Q9ULB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NRXN1Q9ULB1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
NRXN1Q9ULB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NRXN1Q9ULB1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
NRXN1Q9ULB1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NRXN1Q9ULB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NRXN1Q9ULB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NRXN1Q9ULB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NRXN1Q9ULB1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NRXN1Q9ULB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NRXN1Q9ULB1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NRXN1Q9ULB1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NRXN1Q9ULB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NRXN1Q9ULB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NRXN1Q9ULB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN1Q9ULB1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
NRXN1Q9ULB1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms