Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PARP4Q9UKK3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PARP4Q9UKK3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PARP4Q9UKK3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PARP4Q9UKK3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PARP4Q9UKK3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PARP4Q9UKK3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PARP4Q9UKK3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PARP4Q9UKK3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms