Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCNL1Q9UK58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CCNL1Q9UK58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCNL1Q9UK58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCNL1Q9UK58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCNL1Q9UK58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCNL1Q9UK58 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCNL1Q9UK58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCNL1Q9UK58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCNL1Q9UK58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCNL1Q9UK58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCNL1Q9UK58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCNL1Q9UK58 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCNL1Q9UK58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCNL1Q9UK58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms