Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM10Q9UDY6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM10Q9UDY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM10Q9UDY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM10Q9UDY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM10Q9UDY6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM10Q9UDY6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM10Q9UDY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms