Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNG4Q9UBN1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNG4Q9UBN1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNG4Q9UBN1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNG4Q9UBN1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG4Q9UBN1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNG4Q9UBN1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNG4Q9UBN1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms