Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
USP35Q9P2H5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
USP35Q9P2H5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
USP35Q9P2H5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
USP35Q9P2H5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
USP35Q9P2H5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
USP35Q9P2H5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
USP35Q9P2H5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
USP35Q9P2H5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
USP35Q9P2H5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
USP35Q9P2H5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
USP35Q9P2H5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP35Q9P2H5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP35Q9P2H5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP35Q9P2H5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
USP35Q9P2H5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms