Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC56.56■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.56■■■■■ 6.64
CCDC180Q9P1Z9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC56.54■■■■■ 6.64
CCDC180Q9P1Z9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
CCDC180Q9P1Z9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.49■■■■■ 6.63
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.48■■■■■ 6.63
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.47■■■■■ 6.63
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC56.46■■■■■ 6.63
CCDC180Q9P1Z9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.45■■■■■ 6.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC56.43■■■■■ 6.62
CCDC180Q9P1Z9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC56.42■■■■■ 6.62
CCDC180Q9P1Z9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.4■■■■■ 6.62
CCDC180Q9P1Z9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC56.38■■■■■ 6.62
CCDC180Q9P1Z9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.37■■■■■ 6.62
CCDC180Q9P1Z9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC56.36■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC56.36■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.35■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC56.34■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC56.32■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.32■■■■■ 6.61
CCDC180Q9P1Z9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC56.3■■■■■ 6.6
CCDC180Q9P1Z9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC56.29■■■■■ 6.6
CCDC180Q9P1Z9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC56.29■■■■■ 6.6
CCDC180Q9P1Z9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.28■■■■■ 6.6
CCDC180Q9P1Z9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.28■■■■■ 6.6
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC56.24■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.22■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.22■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.21■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC56.2■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.2■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC56.19■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC56.19■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.19■■■■■ 6.59
CCDC180Q9P1Z9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC56.18■■■■■ 6.58
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.15■■■■■ 6.58
CCDC180Q9P1Z9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.15■■■■■ 6.58
CCDC180Q9P1Z9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC56.15■■■■■ 6.58
CCDC180Q9P1Z9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC56.13■■■■■ 6.58
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC56.12■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.11■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC56.1■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC56.09■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.09■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.08■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC56.08■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC56.07■■■■■ 6.57
CCDC180Q9P1Z9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.06■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC56.06■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC56.05■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.04■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC56.04■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.04■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.01■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC56.01■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56■■■■■ 6.56
CCDC180Q9P1Z9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC55.98■■■■■ 6.55
CCDC180Q9P1Z9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.98■■■■■ 6.55
CCDC180Q9P1Z9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC55.97■■■■■ 6.55
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.96■■■■■ 6.55
CCDC180Q9P1Z9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC55.95■■■■■ 6.55
CCDC180Q9P1Z9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC55.95■■■■■ 6.55
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC55.92■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC55.9■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC55.89■■■■■ 6.54
CCDC180Q9P1Z9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC55.87■■■■■ 6.53
CCDC180Q9P1Z9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.85■■■■■ 6.53
CCDC180Q9P1Z9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.83■■■■■ 6.53
CCDC180Q9P1Z9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC55.83■■■■■ 6.53
CCDC180Q9P1Z9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.81■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC55.81■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC55.8■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC55.79■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC55.78■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC55.76■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC55.75■■■■■ 6.52
CCDC180Q9P1Z9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC55.75■■■■■ 6.51
CCDC180Q9P1Z9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.74■■■■■ 6.51
CCDC180Q9P1Z9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC55.73■■■■■ 6.51
CCDC180Q9P1Z9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.71■■■■■ 6.51
CCDC180Q9P1Z9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.67■■■■■ 6.5
CCDC180Q9P1Z9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.67■■■■■ 6.5
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC55.63■■■■■ 6.5
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms