Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTR3BQ9P1U1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR3BQ9P1U1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR3BQ9P1U1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR3BQ9P1U1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTR3BQ9P1U1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTR3BQ9P1U1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3BQ9P1U1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms