Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNKQ9P0W0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNKQ9P0W0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFNKQ9P0W0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFNKQ9P0W0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFNKQ9P0W0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IFNKQ9P0W0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNKQ9P0W0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFNKQ9P0W0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFNKQ9P0W0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFNKQ9P0W0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IFNKQ9P0W0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFNKQ9P0W0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms