Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMCD1Q9NZU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMCD1Q9NZU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMCD1Q9NZU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMCD1Q9NZU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMCD1Q9NZU5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMCD1Q9NZU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMCD1Q9NZU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMCD1Q9NZU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms