Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
BICRAQ9NZM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
BICRAQ9NZM4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
BICRAQ9NZM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC51.66■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.6■■■■■ 5.85
BICRAQ9NZM4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
BICRAQ9NZM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.58■■■■■ 5.85
BICRAQ9NZM4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC51.56■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC51.53■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC51.45■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC51.45■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC51.44■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.38■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC51.38■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.37■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC51.32■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC51.25■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC51.25■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC51.16■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.15■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC51.13■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC51.07■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC51.07■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC50.98■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC50.98■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC50.95■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
BICRAQ9NZM4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
BICRAQ9NZM4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
BICRAQ9NZM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms