Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRHL1Q9NZI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRHL1Q9NZI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRHL1Q9NZI5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRHL1Q9NZI5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRHL1Q9NZI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRHL1Q9NZI5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRHL1Q9NZI5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms