Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NINJ2Q9NZG7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NINJ2Q9NZG7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NINJ2Q9NZG7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NINJ2Q9NZG7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NINJ2Q9NZG7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NINJ2Q9NZG7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NINJ2Q9NZG7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms