Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX01

TXNL4B, Thioredoxin-like protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL4BQ9NX01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNL4BQ9NX01 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNL4BQ9NX01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TXNL4BQ9NX01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TXNL4BQ9NX01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNL4BQ9NX01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNL4BQ9NX01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNL4BQ9NX01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNL4BQ9NX01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNL4BQ9NX01 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNL4BQ9NX01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms