Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARPBPQ9NWS1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARPBPQ9NWS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARPBPQ9NWS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms