Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLIMQ9NVW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLIMQ9NVW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLIMQ9NVW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RLIMQ9NVW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RLIMQ9NVW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms