Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCND1Q9NSA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCND1Q9NSA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCND1Q9NSA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCND1Q9NSA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCND1Q9NSA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCND1Q9NSA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCND1Q9NSA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCND1Q9NSA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms