Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6BQ9NRW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6BQ9NRW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6BQ9NRW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6BQ9NRW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6BQ9NRW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6BQ9NRW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6BQ9NRW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6BQ9NRW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB6BQ9NRW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms