Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR2

TPSG1, Tryptase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPSG1Q9NRR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPSG1Q9NRR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPSG1Q9NRR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPSG1Q9NRR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPSG1Q9NRR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPSG1Q9NRR2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPSG1Q9NRR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TPSG1Q9NRR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPSG1Q9NRR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms