Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMG20AQ9NP66 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMG20AQ9NP66 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMG20AQ9NP66 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMG20AQ9NP66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20AQ9NP66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20AQ9NP66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms