Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PREBQ9HCU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PREBQ9HCU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PREBQ9HCU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PREBQ9HCU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PREBQ9HCU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms