Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC24A3Q9HC58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A3Q9HC58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A3Q9HC58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A3Q9HC58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A3Q9HC58 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms