Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNDIG1Q9H7V2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNDIG1Q9H7V2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYNDIG1Q9H7V2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNDIG1Q9H7V2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNDIG1Q9H7V2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms