Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB1Q9H4B7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB1Q9H4B7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB1Q9H4B7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB1Q9H4B7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB1Q9H4B7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB1Q9H4B7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB1Q9H4B7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms