Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RWDD1Q9H446 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RWDD1Q9H446 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RWDD1Q9H446 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RWDD1Q9H446 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RWDD1Q9H446 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RWDD1Q9H446 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RWDD1Q9H446 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RWDD1Q9H446 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RWDD1Q9H446 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RWDD1Q9H446 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RWDD1Q9H446 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RWDD1Q9H446 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms