Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GGNBP2Q9H3C7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GGNBP2Q9H3C7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GGNBP2Q9H3C7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GGNBP2Q9H3C7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GGNBP2Q9H3C7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GGNBP2Q9H3C7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GGNBP2Q9H3C7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GGNBP2Q9H3C7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GGNBP2Q9H3C7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GGNBP2Q9H3C7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GGNBP2Q9H3C7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GGNBP2Q9H3C7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GGNBP2Q9H3C7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GGNBP2Q9H3C7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GGNBP2Q9H3C7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms