Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS16Q9H269 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS16Q9H269 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS16Q9H269 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS16Q9H269 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS16Q9H269 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS16Q9H269 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS16Q9H269 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS16Q9H269 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS16Q9H269 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS16Q9H269 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS16Q9H269 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS16Q9H269 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS16Q9H269 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS16Q9H269 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms