Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM38Q9H0Z9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM38Q9H0Z9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM38Q9H0Z9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM38Q9H0Z9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM38Q9H0Z9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM38Q9H0Z9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM38Q9H0Z9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms