Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC90BQ9GZT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC90BQ9GZT6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC90BQ9GZT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC90BQ9GZT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms